Nématodes libres et fonctions des sols: mécanismes et déterminisme
HDR soutenue le 3 juillet 2023 à l'Université de Montpellier
Document HDR
Le changement climatique et l’érosion de la biodiversité qui se manifestent à l’échelle mondiale impactent notre agriculture et nous imposent une transition de l’agriculture conventionnelle vers de nouvelles pratiques plus respectueuses de l’environnement pour répondre au défi de produire durablement. Du fait de son importance agronomique, de sa faible disponibilité dans le sol, et de l’état des réserves en roches phosphatées, la gestion de la fertilité du phosphore (P) s’inscrit dans cette transition. Les nématodes bactérivores des sols, en interagissant avec les racines des plantes et les microorganismes, jouent des rôles clefs dans la mobilisation du P pour les cultures via la boucle microbienne des sols. Les travaux menés avec des approches expérimentales au laboratoire nous ont permis de quantifier les effets des nématodes sur les flux de P et sur la croissance des plantes, ainsi que d’identifier les principaux mécanismes de la boucle microbienne. La culture du riz pluvial sur les sols ferrallitiques des hauts-plateaux malgaches a servi de cadre pour identifier les leviers agronomiques susceptibles de piloter la boucle microbienne des sols, parmi lesquels la fertilisation bio-organo-minérale, la diversité végétale et la diversité génétique de la plante cultivée émergent comme prometteurs. L’analyse des effets des pratiques agricoles à l’échelle mondiale nous a également permis de proposer un outil d’aide à la décision en libre accès, SIPANEMA, qui permet de sensibiliser les utilisateurs sur les rôles joués par les nématodes. Cet outil estime les risques de pression parasitaire et de perte du fonctionnement biologique et permet à l’utilisateur de comparer différents scénarios agronomiques. Le projet de recherche proposé s’inscrit dans la nécessité de répondre aux enjeux agro-écologiques et propose d’intensifier et de piloter les interactions biologiques au sein du micro-réseau trophique du sol afin d’améliorer de manière durable les fonctions du sol et de la plante cultivée des agrosystèmes tropicaux et méditerranéens. En prenant en compte à la fois la production de connaissances académiques et le développement d’outils finalisés, le projet s’attache en priorité (i) à la boucle microbienne induite par les différents taxons de nématodes bactérivores comme modèle d’étude, (ii) aux flux de P à l’interface sol-plante, (iii) aux pratiques agricoles affectant la boucle microbienne des sols avec un accent sur la gestion des matières fertilisantes transformées et (iv) au changement climatique susceptible de moduler les effets des pratiques sur les fonctions des sols. L’objectif finalisé est d’affiner nos indicateurs en permettant de mieux prendre en compte l’intensification écologique des fonctions des sols et d’améliorer nos outils d’aide à la décision.