Robin Agnès

RobinAgnesChercheur

CIRAD Brésil

 

 

 

CIRAD, UMR Eco&Sols
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Thème de recherche

Chercheuse au Cirad depuis 2010, je conduis des recherches en Microbiologie et en Ecologie microbienne principalement en plantations forestières tropicales. Depuis septembre 2015, je suis en poste au Brésil à l’Ecole Supérieure de l’Agriculture « Luiz de Queiroz » (ESALQ, Université de São Paulo). Mes recherches visent à comprendre les processus microbiens qui contribuent aux cycles du carbone et des nutriments (N et P) dans les écosystèmes. Il s’agit notamment d’identifier des pratiques culturales (fertilisation, association d’espèces végétales, gestion des rémanents…) et des paramètres environnementaux (type de sols, changements globaux tels que le stress hydrique…) qui modifient/favorisent les activités microbiennes.

Ces recherches prennent en compte d’une façon plus globale l’étude des communautés microbiennes (Bactéries, Champignons et Archaea) et leurs interactions avec d’autres organismes du sol tels que les symbioses mycorhiziennes, en utilisant à la fois des approches moléculaires et des approches de microbiologie classique impliquant la culture de microorganismes. Ces différents aspects sont abordés à travers des projets impliquant des chantiers au sud (Brésil, Congo, Thaïlande) de l’UMR Eco&Sols autour de différentes grandes questions de recherche :

1- Quel est l’impact des systèmes de cultures et des pratiques culturales sur les activités biologiques ?

2- Quel est le rôle des activités microbiennes dans le fonctionnement des sols profonds ?

3- Quels outils moléculaires à développer pour étudier les processus biologiques liés au cycle du P ?

L’objectif finalisé de mes travaux est d’améliorer notre connaissance et notre compréhension des interactions qui s’établissent entre les plantes et les microorganismes (symbiotiques et/ou libres), et qui contribuent au fonctionnement et à la durabilité des agro-écosystèmes.

Publications

Toutes les publications sur ResearcherID (ISI) ou ResearchGate

Prudêncio de Araujo Pereira, A., Avelino Maia de Andrade, P., Bini, D., Durrer, A., Robin, A., Bouillet, J.P., Dini Andreote, F., and Jurandy Bran Nogueira Cardoso, E. (2017) Shifts in the bacterial community composition along deep soil profiles in mono-specific and mixed cultivations of Eucalyptus grandis and Acacia mangium. Plos One, 12, e0180371.

Herrmann, L., Bräu,L., Öpik, M., Robain, H., Wiriyakitnateekul, W., Robin, A., Lesueur, D. (2016) Diversity of arbuscular mycorrhizal fungi in rubber tree rhizospheres in Thailand. Mycorrhiza, 26: 867-877.

Bachega, L., Bouillet, J.P., Piccolo, M.C., Saint-André, L., Bouvet, J.M., Nouvellon, Y., Gonçalves, J.L.M., Robin, A., Laclau, J.P. (2016) Decomposition of Eucalyptus grandis and Acacia mangium leaves and fine roots in tropical conditions: why the Home Field Advantage hypothesis is not verified? Forest Ecology and Management, 359: 33-43.

Waithaisong, K., Robin, A., Martin, A., Clairotte, M., Villeneuve, M., Plassard, C. (2015) Quantification of organic P and low-molecular-weight organic acids in soil extracts by high performance ion chromatograph. Geoderma, 257: 94-101.

Roux, S., Enault, F., Robin, A., Ravet, V., Personnic, S., Theil, S., Colombet, J., Sime-Ngando, T, Debroas, D. (2012) Assessing the diversity and specificity of two freshwater viral communities though metagenomics. PLOS ONE, 7(3): 1-12.

Robin, A., Vansuyt, G., Hinsinger, P., Meyer, J.M., Briat, J.F. Lemanceau, P. (2008) Dynamic of iron in the rhizosphere: consequences for plant growth and health. Advances in Agronomy, 99: 183-225.

Robin, A., Mazurier, S., Mougel, C., Corberand, T., Meyer, J.M., Lemanceau, P. (2007) Diversity of root-associated pseudomonads as affected by ferritin over-expression in tobacco. Environmental Microbiology, 9: 1724-1737.

Vansuyt, G., Robin, A., Briat, J.F., Curie, C., Lemanceau, P. (2007) Iron Acquisition from Fe-Pyoverdine by Arabidopsis thaliana. Molecular Plant-Microbes Interactions, 20: 441-447.
Robin, A., Mougel, C., Siblot, S., Vansuyt, G., Mazurier, S., Lemanceau, P. (2006) Effect of ferritin over-expression in tobacco on the structure of bacterial and pseudomonad communities associated with the roots. FEMS Microbiology Ecology 58: 492-502.

Robin, A., Vansuyt, G., Corberand, T., Briat, J.F., Lemanceau, P. (2006) The soil type affects both the differential accumulation of iron between wild type and ferritin over-expressor tobacco plants and the sensitivity of their rhizospheric microflora to iron stress. Plant and Soil, 283: 73-81.

Chapitre de livre

Hinsinger, P., Herrmann, L., Lesueur, D., Robin, A., Trap, J., Waithaisong, K., Plassard, C. (2015) Impact of roots, microorganisms, and microfauna on the fate of soil phosphorus in the rhizosphere. Phosphorus metabolism in plants in the post-genomic era: from gene to ecosystems; Annual plant review series. Wiley-Blackwell publishing, 48: 377-408.

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